Duda con JavaFX

Turco

Tengo un problema con el uso de JavaFX y cargarlo en la web.

El caso es que cuando exporto el proyecto a un .jar y lo ejecuto en el escritorio, la aplicación funciona a la perfección, pero cuando lo ejecuto en la web (genero el html, jnlp y jar y los meto en la carpeta htdocs de xampp), me carga sólo la interface y no hace nada del resto de la lógica del programa: acceso a base de datos, consultas, métodos para recorrer un directorio, etc.

A groso modo, la interface que está definida en el archivo FXML es un botón, dos checkboxs, una listview y una ventana que captura imagen de vídeo. Pues una vez que se carga la interface (hasta aquí todo bien), en el momento que seleccione un de los dos checkboxs, se debería habilidad el botón que tengo programado para que la ventana se "abra" y empiece a capturar vídeo, pero esto no ocurre.

¿Alguien tiene alguna ligera idea de por qué podría ser?, ¿hay alguna forma de tracear la ejecución por consola para ver si hay algún problema?

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