hola, pues eso que me gustaria tener windows y linux instalado en HDs diferentes, aver si me decis un programa pa cargarlos al ancender, porque los que me bajo no me van.
azias.
el Partition Magic, me imagino que podras darle todo el disco duro a uno y todo del otro al otro xd.
yo lo tengo en dos hds diferentes, simplementes linux en hda y windows en hdb 
, ( instala primero windows, al instalar linux te configura solo el grub o lilo )
Hazte una particion para Linux, con su swap correspondiente y otra para Windows, y, por regla general, el propio arranque de Linux (depende de la distro que uses) te indica las opciones que tu después dentro de Linux puedes modificar (que en el menú te aparezca arrancar la unidad de CD o disquetera, etc..).