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El fin de la paradoja

Después de ese interludio romántico, Donnie vuelve a la fiesta, pero se da cuenta de que vuelve a ver las flechas líquidas en las personas; de alguna manera, recuerda que queda poco tiempo y decide llevar a Gretchen y a dos amigos a ver a Roberta Sparrow (la autora del libro "La Filosofía del Viaje en el Tiempo" donde explica fenómenos similares a los que Donnie experimenta), quien es apodada Abuela Muerte (Grandma Death). Después de entrar en su casa, se encuentra con dos ladrones (el compañero de clase que se lleva mal con Donnie y su amigo), que buscaban las joyas que, aparentemente, Roberta Sparrow tenía.

Tras una pelea, Gretchen cae en la carretera. Mientras, la Abuela Muerte estaba parada en el medio de la carretera, mirando su buzón, ya que Donnie le había escrito una carta con sus reflexiones tras haber leído el libro. Frank estaba conduciendo de vuelta a la fiesta, cuando se encuentra con Roberta Sparrow. Para evitar atropellarla da un volantazo, con lo cual accidentalmente arrolla a Gretchen y la mata. Esta es la ensurance trap (trampa de garantía). Donnie corre hacia el cadáver de su novia, y en un ataque de ira, asesina a Frank disparándole con una pistola semiautomatica en el ojo, deseando hacer todo lo posible para salvar a Gretchen. Cuando amanece, el avión con su madre y hermana menor, pasa por el agujero de gusano y uno de los motores se desprende y es enviado de vuelta en el tiempo. Donnie reaparece en su habitación (en el universo primario), se recuesta en su cama y se ríe mientras el motor cae y lo aplasta. Después de haber experimentado el universo tangencial, y viendo que los caminos de cada ser viviente siguen a través del tiempo, Donnie muere, y salva así la vida de Gretchen, de su madre, de su hermana menor, de Frank y posiblemente de todas las personas que iban en el avión. De acuerdo con el libro La filosofía del viaje en el tiempo, todo receptor vivo muere por el artefacto. Una explicación simple de la película y su final (basado en el comentario en el DVD), es que Donnie tenía que asegurarse (con la ayuda de Frank -un fantasma reverso ya que al estar muerto sirvió de mensajero-) de que ocurra la cadena de eventos que causaron que el motor fuera a través del agujero de gusano. De lo contrario, el portal hubiera causado una paradoja, lo que causaría el fin del mundo y del universo verdadero.
El «Montaje del Director»

Richard Kelly ha presentado sus propias reflexiones acerca de la película en la edición Director’s Cut, del DVD. Esta edición incluye el libro ficticio La filosofía del viaje en el tiempo, así como varias entrevistas. Su opinión acerca de la película es la siguiente:

A medianoche, el universo tangencial se separa del universo primario, gracias a la aparición de un artefacto, representado por un motor de avión. Los universos tangenciales son inestables y generalmente colapsan en menos de un mes, llevándose el universo primario consigo, si no es cerrado previamente. Cerrar el universo tangencial es un deber del receptor vivo (Donnie), el cual le da superpoderes para realizar su tarea. Aquellos que hayan muerto dentro del universo tangencial se transforman en los muertos manipulados (Frank y ―de acuerdo con la última hoja del libro La filosofía del viaje en el tiempo― Gretchen), que también reciben ciertos poderes, y entienden lo que pasa, y la habilidad de contactar con el receptor vivo a través de la cuarta construcción dimensional (el agua). Todos los que rodean al receptor vivo son los manipulados vivos que (inconscientemente) son empujados a llevar al receptor vivo a cumplir su destino, cerrar el universo tangencial y, aparentemente, a morir por el artefacto.[/spoiler]